事业编和公务员主要是在工资来源、工资待遇、编制岗位之间的转换、晋升发展路线、编制性质等方面有区别。
一、工资的来源不同
公务员编制就是单位工作的正式人员，其工资由财政全供。事业单位工资由财政全供或者财政部分供给或者自收自支。事业编制人员缴纳失业保险、公务员编制人员不缴纳失业保险。
二、工资待遇差距大
事业单位人员的工资并不如公务员稳定。而且由于经费限制，除参公单位外的其他单位，工资待遇普遍要低于当地公务员。除了基本工资以外，事业单位的补贴、年终奖通常也要低于公务员。比如公务员的车补，就是事业单位人员享受不到的。一般来说，同一个地方的事业单位人员，总收入要比公务员低三分之一左右。
三、编制岗位之间的转换不同
在县级党政机关，一个单位公务员和事业单位人员往往不区分，局机关里公务员编制很少，大部分都是下属事业编制的人。县委可以直接将事业编制的股长提拔为县局的副局长，自动就转为公务员编制了。
通常到了市里以上的级别，公务员和事业编制就区分得很明显，工作人员一般不大范围的交叉，一般是各司其职，各负其职，尤其是副科以下的人员岗位之间一般不能相互转换，但是到了副科就可以相互转换。比如可以从事业单位里直接提拔人到局机关当副科长或科长，也自动转为公务员编制了。
四、晋升发展路线不同
公务员想要晋升发展，需要提升自己的职务和行政级别，像我们常说的科级、处级、厅级等，是很难的。事业单位的发展路线主要是评职称，而职称评审难度很大，且最关键的是有名额限制，这也注定了很多事业单位人员是评不上高职称的。大量事业单位人员职称上不去，发展前景自然也不容乐观了。
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