事业单位有收入来源、行业、性质特点三种分类方式：
按收入来源事业单位分类
一般是按照其收入来源分类，可以分为"全额拨款"、"参公(即参照公务员)"、"财政补贴"、"自收自支"四类。
1.全额拨款事业单位也称为全供事业单位，也就是全额预算管理的事业单位，是其所需的事业经费全部由预算拨款的一种管理形式。
2.“参公(即参照公务员)”是一些涉及安全，对政策和经济管理工作有明确辅助作用，以及明显以社会公益性为属性的事业单位。
3.财政补贴又称差额拨款事业单位，按差额比例，财政承担部分，由财政列入预算;单位承担部分，由单位在税前列支，如医院等。
4.自主事业单位又称为自收自支事业单位，是不拨款的事业单位。
按行业事业单位分类
大致分为教育、科研、勘察设计、勘探、文化、卫生、体育、新闻出版、农林牧水、交通、气象、地震、海洋、环保、测绘、信息咨询、标准计量、知识产权、进出口商检、城市公用、物资仓储、社会福利、经济监督、机关后勤及其他25个行业类别。
按性质和特点事业单位分类
可分为具有非政府公共机构性质的事业单位，如社会科学联合会、社会科学院、基础理论研究所、图书馆、博物馆、计划生育协会等；具有一定经济效益的公益性事业单位，如养老院、大专院校、中小学校、重要的医疗卫生单位、疗养院、考试管理中心等；具有生产经营性和能力的事业单位，如从事应用技术研究科研院所、广播电视台、报纸、刊物和出版社、城市公用方面的市政管理、房产管理、园林设计等单位。
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